蔬菜育种室主要从事蔬菜新品种选育工作，有科研人员42人。目前主要从事茄果类的番茄、茄子、辣椒，豆类的长豇豆、菜豆、菜用大豆、豌豆等，十字花科的萝卜、大白菜、青菜、甘蓝、花椰菜和青花菜，瓜类的瓠瓜、黄瓜、苦瓜、西瓜、甜瓜、丝瓜等蔬菜新品种选育和栽培技术的研究和开发工作。承担多项国家攻关和部省重大重点项目。上世纪八十年代以来，在收集、引进、研究、鉴定各种优良品种资源的基础上，先后育成瓜果菜新品种50余个。番茄浙粉202、浙杂203、浙杂204、浙杂805、浙杂205、浙粉702、浙杂301、浙砧1号，茄子浙茄1号、引茄1号、浙茄3号、浙茄28号、紫秋、红枫、紫藤、黑旋风，辣椒浙椒1号，长豇豆之豇90、之豇翠绿、之豇特长80、之豇特早30、之豇28-2、之豇矮蔓1号、秋豇512、紫秋豇6号，菜豆浙芸3号、无筋2号，菜用大豆浙农6号、浙农8号、夏丰2008、春丰早，豌豆浙豌1号，萝卜白雪春2号、浙萝2号、浙萝3号，大白菜早熟5号、早熟6号、早熟8号、浙白4号、浙白6号、浙白9号、浙白10号、黄芽14，青菜青丰1号、青丰2号、浙青1号，甘蓝浙甘7号、浙甘12号、浙甘14号、浙甘15号，瓠瓜浙蒲2号，黄瓜浙秀1号，苦瓜浙绿1号，西瓜金奖章、红和平，甜瓜翠雪5号、红玛丽、红状元，丝瓜浙丝35，黄秋葵纤指等蔬菜新品种目前正在生产上推广应用。获得国家、部省各级奖项20余项，其中豇豆之豇28-2获国家发明二等奖，大白菜品种“早熟5号”获国家科技进步三等奖。创造社会经济效益200亿元以上。目前保存有各类蔬菜种质资源10000多份，其中相当部分是具有我省特色的优势种类和地方品种；并与世界上一些著名的育种研究机构如亚洲蔬菜研究发展中心、欧洲蔬菜育种协会等保持良好的关系，每年引进和种蔬菜品种资源100份以上，为我省的蔬菜品种资源研究与新品种选育提供了良好的条件。

        近年来，蔬菜所在育种技术、种质创新与鉴定利用技术研究上取得显著进展：研究开发了番茄、豇豆、瓠瓜、大白菜等蔬菜作物重要抗病分子标记，并成功应用于抗病基因的聚合和育种实践；创新性地开展了普通豇豆cSNPs引物在长豇豆上的转移利用工作；研究建立了青花菜、白菜小孢子离体培养技术和以小孢子培养为核心技术的花椰菜、青花菜高效育种技术，构建了与核心技术相配套的分子标记辅助选择及非对称性融合体细胞杂交种质创新技术，这些技术达国内领先或国际先进水平。此外，通过远缘杂交等外源基因的转移利用技术，创新获得了一大批优异种质材料，为后续育种研究奠定了坚实的基础。